Prof. Matthys studeerde geneeskunde aan de UGent en specialiseerde in psychiatrie in Antwerpen. Zij volgde een opleiding client-centered  therapie in Leuven en behaalde een postgraduaat in “Ziekenhuisbeleid en –management".

In 2014 promoveerde zij aan de Universiteit van Antwerpen tot doctor in de Medische Wetenschappen.

Gedurende meer dan twintig jaar was zij lid van het dagelijks bestuur van het Vlaams expertisecentrum voor Alcohol en Drugs (VAD), waarvan tien jaar als voorzitter.

Prof. Matthys nam initiatief als oprichter van het Forum Verslavingsgeneeskunde in VAD en van de sectie Verslavingspsychiatrie binnen de VVP. Momenteel is zij uittredend voorzitter van de Vlaamse Vereniging voor Psychiatrie (VVP).

Zij is verbonden aan de VUB waar ze tot oktober 2022 titularis was van de vakken psychiatrie en medische psychologie aan de faculteit Geneeskunde en Farmacie en tot 2019 diensthoofd psychiatrie in het UZBrussel.

Sinds voorjaar 2021 is zij lid van de kansspelcommissie waar ze bij elke beslissing het effect bekijkt op de bescherming van de spelers.

Zij is één van de trekkers van de SGGG – Staten-Generaal Geestelijke Gezondheidszorg (statengeneraalggz.be)

Sinds maart 2022 is zij voorzitter van de vzw Psyche.